А не ддос (DDOS) ли на сервере ?

Если у вас есть подозрения на ддос на сервере linux, можно это просто проверить:

Число коннектов на 80 порт: 

netstat -na | grep :80 | wc -l 

Посмотреть много ли разных IP: 

netstat -na | grep :80 | grep SYN | sort -u | more

После этого вы можете с легкостью сказать есть ли DDOS на ваш сервер. 

Есть проблемы с безопасностью сервера ? Обращайтесь — [email protected]