Если у вас на системе виртуализации ESX повредился файл VMDK, первое что необходимо, использовать утилиту
vmkfstools —fix check disk-s001.vmdk
После этого мы можем использовать команду для ремонта диска:
vmkfstools —fix repair disk-s001.vmdk
Так же можно пропробовать скопировать старый диск в новый:
vmkfstools -i disk-s001.vmdk disk-new.vmdk