для начала проверим где squid хранит свой кэш:
# grep cache_dir /etc/squid/squid.conf
Обычно это директория: 
cache_dir ufs /var/spool/squid 100 16 256
выключаем squid:
squid -k shutdown
Удаляем директории с кэшем:
# rm -rf /path/to/dir/cache/
# rm -rf /var/spool/squid/
Создаем директории и назначаем права:
# mkdir /var/spool/squid
# chown squid:squid /var/spool/squid
Создаем кэш директории:
squid -z
Запускаем squid: 
service squid start
Есть проблемы с прокси серверовм SQUID ? Обращайтесь — [email protected]