Если вам необходимо сделать зеркальную копию сервера ftp, воспользоваться командой rsync к сожелению не получиться.
Необходимо использовать программу lftp:
1. Подключаемся к серверу:
lftp server1.intra.net
2. Вводим логин и пароль:
user user@server1.intra.net
3. Далее можем сделать зеркало:
mirror source target
Например: 
mirror logs/ /data/wwwlogs
Есть проблемы с сервером Linux ? Обращайтесь — Office@itfb.com.ua