Не переживайте, с вашей памятью всё ОК ! Linux заимствует неиспользуемую память для кэширования. Это выглядит как нет памяти! Но,  Все отлично!
Кэширование делают систему намного быстрее ! Единственный минус — это путаница для новичков. Рассмотрим на примере команды free:
             total       used       free     shared    buffers     cached
Mem:          2026       1895        131          0        108       1367
-/+ buffers/cache:        418       1607
Swap:         4031         40       3991
Как мы видим всего памяти на сервере — 2 ГБ. Из них занятно — 1895 МБ, и закэшированы 1607МБ
Если у вас есть проблемы или вопросы по Linux, Обращайтесь — office@itfb.com.ua